Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ercc6F8VPZ5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Ercc6F8VPZ5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Ercc6F8VPZ5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Ercc6F8VPZ5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Ercc6F8VPZ5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ercc6F8VPZ5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ercc6F8VPZ5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Ercc6F8VPZ5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ercc6F8VPZ5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ercc6F8VPZ5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ercc6F8VPZ5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ercc6F8VPZ5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ercc6F8VPZ5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ercc6F8VPZ5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Ercc6F8VPZ5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ercc6F8VPZ5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ercc6F8VPZ5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ercc6F8VPZ5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ercc6F8VPZ5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ercc6F8VPZ5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ercc6F8VPZ5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ercc6F8VPZ5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ercc6F8VPZ5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ercc6F8VPZ5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ercc6F8VPZ5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Ercc6F8VPZ5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ercc6F8VPZ5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Ercc6F8VPZ5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ercc6F8VPZ5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ercc6F8VPZ5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ercc6F8VPZ5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ercc6F8VPZ5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ercc6F8VPZ5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ercc6F8VPZ5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ercc6F8VPZ5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ercc6F8VPZ5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ercc6F8VPZ5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ercc6F8VPZ5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ercc6F8VPZ5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ercc6F8VPZ5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ercc6F8VPZ5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ercc6F8VPZ5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ercc6F8VPZ5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Ercc6F8VPZ5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ercc6F8VPZ5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Ercc6F8VPZ5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ercc6F8VPZ5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ercc6F8VPZ5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ercc6F8VPZ5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ercc6F8VPZ5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ercc6F8VPZ5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ercc6F8VPZ5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ercc6F8VPZ5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ercc6F8VPZ5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ercc6F8VPZ5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ercc6F8VPZ5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ercc6F8VPZ5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ercc6F8VPZ5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ercc6F8VPZ5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ercc6F8VPZ5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ercc6F8VPZ5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ercc6F8VPZ5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Ercc6F8VPZ5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Ercc6F8VPZ5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ercc6F8VPZ5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ercc6F8VPZ5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ercc6F8VPZ5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ercc6F8VPZ5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ercc6F8VPZ5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ercc6F8VPZ5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ercc6F8VPZ5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ercc6F8VPZ5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ercc6F8VPZ5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ercc6F8VPZ5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ercc6F8VPZ5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ercc6F8VPZ5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ercc6F8VPZ5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ercc6F8VPZ5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ercc6F8VPZ5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ercc6F8VPZ5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ercc6F8VPZ5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ercc6F8VPZ5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ercc6F8VPZ5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ercc6F8VPZ5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ercc6F8VPZ5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ercc6F8VPZ5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ercc6F8VPZ5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ercc6F8VPZ5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ercc6F8VPZ5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ercc6F8VPZ5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ercc6F8VPZ5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ercc6F8VPZ5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ercc6F8VPZ5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ercc6F8VPZ5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ercc6F8VPZ5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ercc6F8VPZ5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ercc6F8VPZ5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ercc6F8VPZ5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ercc6F8VPZ5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms