Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms