Protein–RNA interactions for Protein: F8VPP8

Zc3h7b, Zinc finger CCCH type-containing 7B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h7bF8VPP8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3h7bF8VPP8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms