Protein–RNA interactions for Protein: F6SKY8

Gm3072, Predicted gene 3072 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3072F6SKY8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3072F6SKY8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms