Protein–RNA interactions for Protein: F6SG70

Gm28374, Predicted gene 28374 (Fragment), mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28374F6SG70 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28374F6SG70 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28374F6SG70 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28374F6SG70 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28374F6SG70 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28374F6SG70 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28374F6SG70 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28374F6SG70 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28374F6SG70 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28374F6SG70 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28374F6SG70 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28374F6SG70 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28374F6SG70 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28374F6SG70 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28374F6SG70 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28374F6SG70 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28374F6SG70 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28374F6SG70 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28374F6SG70 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28374F6SG70 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28374F6SG70 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28374F6SG70 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28374F6SG70 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28374F6SG70 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28374F6SG70 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28374F6SG70 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28374F6SG70 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28374F6SG70 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28374F6SG70 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28374F6SG70 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28374F6SG70 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28374F6SG70 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm28374F6SG70 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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