Protein–RNA interactions for Protein: F6S200

Plekhg1, Pleckstrin homology domain-containing, family G (with RhoGef domain) member 1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhg1F6S200 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Plekhg1F6S200 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Plekhg1F6S200 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Plekhg1F6S200 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Plekhg1F6S200 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Plekhg1F6S200 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Plekhg1F6S200 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Plekhg1F6S200 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Plekhg1F6S200 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Plekhg1F6S200 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Plekhg1F6S200 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Plekhg1F6S200 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Plekhg1F6S200 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Plekhg1F6S200 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Plekhg1F6S200 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Plekhg1F6S200 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Plekhg1F6S200 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Plekhg1F6S200 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Plekhg1F6S200 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Plekhg1F6S200 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Plekhg1F6S200 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Plekhg1F6S200 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Plekhg1F6S200 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Plekhg1F6S200 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Plekhg1F6S200 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Plekhg1F6S200 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Plekhg1F6S200 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Plekhg1F6S200 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Plekhg1F6S200 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Plekhg1F6S200 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Plekhg1F6S200 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Plekhg1F6S200 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Plekhg1F6S200 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Plekhg1F6S200 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Plekhg1F6S200 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Plekhg1F6S200 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Plekhg1F6S200 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Plekhg1F6S200 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Plekhg1F6S200 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Plekhg1F6S200 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Plekhg1F6S200 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Plekhg1F6S200 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Plekhg1F6S200 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Plekhg1F6S200 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Plekhg1F6S200 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Plekhg1F6S200 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Plekhg1F6S200 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Plekhg1F6S200 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Plekhg1F6S200 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Plekhg1F6S200 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Plekhg1F6S200 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Plekhg1F6S200 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Plekhg1F6S200 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Plekhg1F6S200 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Plekhg1F6S200 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Plekhg1F6S200 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Plekhg1F6S200 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Plekhg1F6S200 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Plekhg1F6S200 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms