Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms