Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm29094F6Q785 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms