Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rnf165E9QAU8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf165E9QAU8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms