Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cald1E9QA15 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cald1E9QA15 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms