Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TrdnE9Q9K5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms