Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc146E9Q9F7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc146E9Q9F7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc146E9Q9F7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc146E9Q9F7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc146E9Q9F7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc146E9Q9F7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc146E9Q9F7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc146E9Q9F7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc146E9Q9F7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc146E9Q9F7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc146E9Q9F7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc146E9Q9F7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc146E9Q9F7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc146E9Q9F7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc146E9Q9F7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc146E9Q9F7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc146E9Q9F7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc146E9Q9F7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc146E9Q9F7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc146E9Q9F7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc146E9Q9F7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc146E9Q9F7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc146E9Q9F7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc146E9Q9F7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc146E9Q9F7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc146E9Q9F7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc146E9Q9F7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc146E9Q9F7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc146E9Q9F7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc146E9Q9F7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc146E9Q9F7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc146E9Q9F7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc146E9Q9F7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc146E9Q9F7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc146E9Q9F7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc146E9Q9F7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms