Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col22a1E9Q7P1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Col22a1E9Q7P1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col22a1E9Q7P1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col22a1E9Q7P1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col22a1E9Q7P1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col22a1E9Q7P1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Col22a1E9Q7P1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col22a1E9Q7P1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col22a1E9Q7P1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Col22a1E9Q7P1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col22a1E9Q7P1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col22a1E9Q7P1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col22a1E9Q7P1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col22a1E9Q7P1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col22a1E9Q7P1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Col22a1E9Q7P1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Col22a1E9Q7P1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Col22a1E9Q7P1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Col22a1E9Q7P1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Col22a1E9Q7P1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Col22a1E9Q7P1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col22a1E9Q7P1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col22a1E9Q7P1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col22a1E9Q7P1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col22a1E9Q7P1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col22a1E9Q7P1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col22a1E9Q7P1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Col22a1E9Q7P1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col22a1E9Q7P1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col22a1E9Q7P1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col22a1E9Q7P1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col22a1E9Q7P1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col22a1E9Q7P1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col22a1E9Q7P1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Col22a1E9Q7P1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms