Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Urb2E9Q7L1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Urb2E9Q7L1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
Urb2E9Q7L1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Urb2E9Q7L1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Urb2E9Q7L1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Urb2E9Q7L1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Urb2E9Q7L1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Urb2E9Q7L1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Urb2E9Q7L1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Urb2E9Q7L1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Urb2E9Q7L1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Urb2E9Q7L1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Urb2E9Q7L1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Urb2E9Q7L1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Urb2E9Q7L1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Urb2E9Q7L1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Urb2E9Q7L1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Urb2E9Q7L1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Urb2E9Q7L1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Urb2E9Q7L1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Urb2E9Q7L1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Urb2E9Q7L1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Urb2E9Q7L1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Urb2E9Q7L1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Urb2E9Q7L1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Urb2E9Q7L1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Urb2E9Q7L1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Urb2E9Q7L1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Urb2E9Q7L1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Urb2E9Q7L1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Urb2E9Q7L1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Urb2E9Q7L1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Urb2E9Q7L1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Urb2E9Q7L1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Urb2E9Q7L1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Urb2E9Q7L1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Urb2E9Q7L1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Urb2E9Q7L1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Urb2E9Q7L1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Urb2E9Q7L1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Urb2E9Q7L1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Urb2E9Q7L1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Urb2E9Q7L1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Urb2E9Q7L1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Urb2E9Q7L1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Urb2E9Q7L1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Urb2E9Q7L1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Urb2E9Q7L1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Urb2E9Q7L1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Urb2E9Q7L1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Urb2E9Q7L1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Urb2E9Q7L1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Urb2E9Q7L1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Urb2E9Q7L1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Urb2E9Q7L1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Urb2E9Q7L1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Urb2E9Q7L1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Urb2E9Q7L1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms