Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R7

Utrn, Utrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UtrnE9Q6R7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UtrnE9Q6R7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UtrnE9Q6R7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UtrnE9Q6R7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UtrnE9Q6R7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UtrnE9Q6R7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UtrnE9Q6R7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UtrnE9Q6R7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UtrnE9Q6R7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UtrnE9Q6R7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UtrnE9Q6R7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UtrnE9Q6R7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UtrnE9Q6R7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UtrnE9Q6R7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UtrnE9Q6R7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UtrnE9Q6R7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UtrnE9Q6R7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UtrnE9Q6R7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UtrnE9Q6R7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UtrnE9Q6R7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UtrnE9Q6R7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UtrnE9Q6R7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UtrnE9Q6R7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UtrnE9Q6R7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UtrnE9Q6R7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UtrnE9Q6R7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UtrnE9Q6R7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UtrnE9Q6R7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UtrnE9Q6R7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UtrnE9Q6R7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms