Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Simc1E9Q6E9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Simc1E9Q6E9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Simc1E9Q6E9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Simc1E9Q6E9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Simc1E9Q6E9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Simc1E9Q6E9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Simc1E9Q6E9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Simc1E9Q6E9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Simc1E9Q6E9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Simc1E9Q6E9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Simc1E9Q6E9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Simc1E9Q6E9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Simc1E9Q6E9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Simc1E9Q6E9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Simc1E9Q6E9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Simc1E9Q6E9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Simc1E9Q6E9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Simc1E9Q6E9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Simc1E9Q6E9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Simc1E9Q6E9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Simc1E9Q6E9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Simc1E9Q6E9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Simc1E9Q6E9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Simc1E9Q6E9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Simc1E9Q6E9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Simc1E9Q6E9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Simc1E9Q6E9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Simc1E9Q6E9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Simc1E9Q6E9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Simc1E9Q6E9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Simc1E9Q6E9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Simc1E9Q6E9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Simc1E9Q6E9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Simc1E9Q6E9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Simc1E9Q6E9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Simc1E9Q6E9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Simc1E9Q6E9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Simc1E9Q6E9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Simc1E9Q6E9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Simc1E9Q6E9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Simc1E9Q6E9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms