Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc85cE9Q6B2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc85cE9Q6B2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms