Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DspE9Q557 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DspE9Q557 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DspE9Q557 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DspE9Q557 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DspE9Q557 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DspE9Q557 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DspE9Q557 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DspE9Q557 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DspE9Q557 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DspE9Q557 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DspE9Q557 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DspE9Q557 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DspE9Q557 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DspE9Q557 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DspE9Q557 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DspE9Q557 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DspE9Q557 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DspE9Q557 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DspE9Q557 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms