Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4E0

5031410I06Rik, RIKEN cDNA 5031410I06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5031410I06RikE9Q4E0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
5031410I06RikE9Q4E0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
5031410I06RikE9Q4E0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
5031410I06RikE9Q4E0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
5031410I06RikE9Q4E0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
5031410I06RikE9Q4E0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
5031410I06RikE9Q4E0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
5031410I06RikE9Q4E0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
5031410I06RikE9Q4E0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
5031410I06RikE9Q4E0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
5031410I06RikE9Q4E0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
5031410I06RikE9Q4E0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
5031410I06RikE9Q4E0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
5031410I06RikE9Q4E0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
5031410I06RikE9Q4E0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
5031410I06RikE9Q4E0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
5031410I06RikE9Q4E0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
5031410I06RikE9Q4E0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
5031410I06RikE9Q4E0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
5031410I06RikE9Q4E0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
5031410I06RikE9Q4E0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
5031410I06RikE9Q4E0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
5031410I06RikE9Q4E0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
5031410I06RikE9Q4E0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
5031410I06RikE9Q4E0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
5031410I06RikE9Q4E0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
5031410I06RikE9Q4E0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
5031410I06RikE9Q4E0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
5031410I06RikE9Q4E0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
5031410I06RikE9Q4E0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
5031410I06RikE9Q4E0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
5031410I06RikE9Q4E0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
5031410I06RikE9Q4E0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
5031410I06RikE9Q4E0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
5031410I06RikE9Q4E0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
5031410I06RikE9Q4E0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
5031410I06RikE9Q4E0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
5031410I06RikE9Q4E0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
5031410I06RikE9Q4E0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
5031410I06RikE9Q4E0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
5031410I06RikE9Q4E0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
5031410I06RikE9Q4E0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
5031410I06RikE9Q4E0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms