Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r238E9Q373 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r238E9Q373 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r238E9Q373 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r238E9Q373 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r238E9Q373 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r238E9Q373 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r238E9Q373 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r238E9Q373 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r238E9Q373 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r238E9Q373 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r238E9Q373 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r238E9Q373 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r238E9Q373 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r238E9Q373 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r238E9Q373 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r238E9Q373 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r238E9Q373 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r238E9Q373 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r238E9Q373 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r238E9Q373 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r238E9Q373 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r238E9Q373 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r238E9Q373 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r238E9Q373 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r238E9Q373 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r238E9Q373 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r238E9Q373 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r238E9Q373 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r238E9Q373 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r238E9Q373 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r238E9Q373 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r238E9Q373 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r238E9Q373 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms