Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
5430401F13RikE9Q328 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms