Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrp3E9Q1T6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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