Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt78E9Q0F0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt78E9Q0F0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms