Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Fndc1E9Q043 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Fndc1E9Q043 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Fndc1E9Q043 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Fndc1E9Q043 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Fndc1E9Q043 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Fndc1E9Q043 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Fndc1E9Q043 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Fndc1E9Q043 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Fndc1E9Q043 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Fndc1E9Q043 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Fndc1E9Q043 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Fndc1E9Q043 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Fndc1E9Q043 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Fndc1E9Q043 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Fndc1E9Q043 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Fndc1E9Q043 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Fndc1E9Q043 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Fndc1E9Q043 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Fndc1E9Q043 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Fndc1E9Q043 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Fndc1E9Q043 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Fndc1E9Q043 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Fndc1E9Q043 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Fndc1E9Q043 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Fndc1E9Q043 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Fndc1E9Q043 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Fndc1E9Q043 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Fndc1E9Q043 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Fndc1E9Q043 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Fndc1E9Q043 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Fndc1E9Q043 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Fndc1E9Q043 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Fndc1E9Q043 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Fndc1E9Q043 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Fndc1E9Q043 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Fndc1E9Q043 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Fndc1E9Q043 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Fndc1E9Q043 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Fndc1E9Q043 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Fndc1E9Q043 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Fndc1E9Q043 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Fndc1E9Q043 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Fndc1E9Q043 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Fndc1E9Q043 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Fndc1E9Q043 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Fndc1E9Q043 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Fndc1E9Q043 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Fndc1E9Q043 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Fndc1E9Q043 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Fndc1E9Q043 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Fndc1E9Q043 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Fndc1E9Q043 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Fndc1E9Q043 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms