Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms