Protein–RNA interactions for Protein: E9PVJ0

Gm2956, Predicted gene 2956, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2956E9PVJ0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm2956E9PVJ0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm2956E9PVJ0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm2956E9PVJ0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm2956E9PVJ0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm2956E9PVJ0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm2956E9PVJ0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm2956E9PVJ0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms