Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms