Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Piezo1E2JF22 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Piezo1E2JF22 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms