Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
3425401B19RikD3Z1D3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
3425401B19RikD3Z1D3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
3425401B19RikD3Z1D3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
3425401B19RikD3Z1D3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
3425401B19RikD3Z1D3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
3425401B19RikD3Z1D3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
3425401B19RikD3Z1D3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
3425401B19RikD3Z1D3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
3425401B19RikD3Z1D3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
3425401B19RikD3Z1D3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
3425401B19RikD3Z1D3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
3425401B19RikD3Z1D3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
3425401B19RikD3Z1D3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
3425401B19RikD3Z1D3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
3425401B19RikD3Z1D3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
3425401B19RikD3Z1D3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
3425401B19RikD3Z1D3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
3425401B19RikD3Z1D3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
3425401B19RikD3Z1D3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
3425401B19RikD3Z1D3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
3425401B19RikD3Z1D3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
3425401B19RikD3Z1D3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
3425401B19RikD3Z1D3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
3425401B19RikD3Z1D3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms