Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc6D3YZP9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc6D3YZP9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc6D3YZP9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc6D3YZP9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc6D3YZP9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc6D3YZP9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc6D3YZP9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc6D3YZP9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc6D3YZP9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc6D3YZP9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc6D3YZP9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc6D3YZP9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc6D3YZP9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc6D3YZP9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc6D3YZP9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc6D3YZP9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc6D3YZP9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc6D3YZP9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc6D3YZP9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc6D3YZP9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc6D3YZP9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc6D3YZP9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc6D3YZP9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc6D3YZP9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc6D3YZP9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc6D3YZP9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc6D3YZP9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc6D3YZP9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc6D3YZP9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc6D3YZP9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc6D3YZP9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc6D3YZP9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc6D3YZP9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc6D3YZP9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
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