Protein–RNA interactions for Protein: D3YYB5

Gm42791, Predicted gene 42791 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42791D3YYB5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm42791D3YYB5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm42791D3YYB5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm42791D3YYB5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm42791D3YYB5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm42791D3YYB5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm42791D3YYB5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm42791D3YYB5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm42791D3YYB5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm42791D3YYB5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm42791D3YYB5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm42791D3YYB5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm42791D3YYB5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm42791D3YYB5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms