Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kif28pD3YXS5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms