Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc170D3YXL0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms