Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rexo5D3YW29 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms