Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim30cD3YVI9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim30cD3YVI9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms