Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms