Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cttnbp2B9EJA2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cttnbp2B9EJA2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cttnbp2B9EJA2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cttnbp2B9EJA2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Cttnbp2B9EJA2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Cttnbp2B9EJA2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Cttnbp2B9EJA2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Cttnbp2B9EJA2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Cttnbp2B9EJA2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Cttnbp2B9EJA2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Cttnbp2B9EJA2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Cttnbp2B9EJA2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cttnbp2B9EJA2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cttnbp2B9EJA2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cttnbp2B9EJA2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cttnbp2B9EJA2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cttnbp2B9EJA2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cttnbp2B9EJA2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cttnbp2B9EJA2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cttnbp2B9EJA2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cttnbp2B9EJA2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cttnbp2B9EJA2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cttnbp2B9EJA2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cttnbp2B9EJA2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Cttnbp2B9EJA2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Cttnbp2B9EJA2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Cttnbp2B9EJA2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Cttnbp2B9EJA2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Cttnbp2B9EJA2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Cttnbp2B9EJA2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Cttnbp2B9EJA2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Cttnbp2B9EJA2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Cttnbp2B9EJA2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cttnbp2B9EJA2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cttnbp2B9EJA2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Cttnbp2B9EJA2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cttnbp2B9EJA2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cttnbp2B9EJA2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Cttnbp2B9EJA2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cttnbp2B9EJA2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cttnbp2B9EJA2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cttnbp2B9EJA2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Cttnbp2B9EJA2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Cttnbp2B9EJA2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Cttnbp2B9EJA2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Cttnbp2B9EJA2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Cttnbp2B9EJA2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cttnbp2B9EJA2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cttnbp2B9EJA2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cttnbp2B9EJA2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cttnbp2B9EJA2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cttnbp2B9EJA2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cttnbp2B9EJA2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cttnbp2B9EJA2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Cttnbp2B9EJA2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Cttnbp2B9EJA2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cttnbp2B9EJA2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cttnbp2B9EJA2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cttnbp2B9EJA2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cttnbp2B9EJA2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cttnbp2B9EJA2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cttnbp2B9EJA2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cttnbp2B9EJA2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Cttnbp2B9EJA2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Cttnbp2B9EJA2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Cttnbp2B9EJA2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Cttnbp2B9EJA2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cttnbp2B9EJA2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cttnbp2B9EJA2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cttnbp2B9EJA2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cttnbp2B9EJA2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cttnbp2B9EJA2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cttnbp2B9EJA2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cttnbp2B9EJA2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cttnbp2B9EJA2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Cttnbp2B9EJA2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms