Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mterf1bB9EJ57 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms