Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clip3B9EHT4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms