Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pnldc1B2RXZ1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms