Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppfia1B2RXQ2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms