Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms