Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
AU015836B2RUM3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms