Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Apol7aB2RT54 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Apol7aB2RT54 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms