Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms