Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm2012B1B0R1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm2012B1B0R1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms