Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nipsnap3aB1AWZ3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms