Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scml2B1AVB3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scml2B1AVB3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scml2B1AVB3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scml2B1AVB3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scml2B1AVB3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scml2B1AVB3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scml2B1AVB3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scml2B1AVB3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scml2B1AVB3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scml2B1AVB3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scml2B1AVB3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scml2B1AVB3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scml2B1AVB3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scml2B1AVB3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scml2B1AVB3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scml2B1AVB3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scml2B1AVB3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scml2B1AVB3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scml2B1AVB3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scml2B1AVB3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scml2B1AVB3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scml2B1AVB3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scml2B1AVB3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scml2B1AVB3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scml2B1AVB3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scml2B1AVB3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scml2B1AVB3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms