Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms