Protein–RNA interactions for Protein: A6H6T1

Prss40, Serine protease 40, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss40A6H6T1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prss40A6H6T1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prss40A6H6T1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prss40A6H6T1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prss40A6H6T1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prss40A6H6T1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prss40A6H6T1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prss40A6H6T1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prss40A6H6T1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prss40A6H6T1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prss40A6H6T1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prss40A6H6T1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prss40A6H6T1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prss40A6H6T1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prss40A6H6T1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prss40A6H6T1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prss40A6H6T1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prss40A6H6T1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Prss40A6H6T1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Prss40A6H6T1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Prss40A6H6T1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prss40A6H6T1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prss40A6H6T1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Prss40A6H6T1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prss40A6H6T1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prss40A6H6T1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prss40A6H6T1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prss40A6H6T1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prss40A6H6T1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prss40A6H6T1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prss40A6H6T1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prss40A6H6T1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prss40A6H6T1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prss40A6H6T1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prss40A6H6T1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Prss40A6H6T1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prss40A6H6T1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prss40A6H6T1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prss40A6H6T1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prss40A6H6T1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prss40A6H6T1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prss40A6H6T1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Prss40A6H6T1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prss40A6H6T1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prss40A6H6T1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prss40A6H6T1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prss40A6H6T1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prss40A6H6T1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prss40A6H6T1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prss40A6H6T1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms